流式實(shí)驗(yàn)結(jié)果出現(xiàn)非特異性染色,可能的原因(如抗體交叉反應(yīng)、樣本雜質(zhì)干擾)有哪些?如何通過(guò)對(duì)照實(shí)驗(yàn)排查?
日期:2025-09-29 13:47:19
在流式實(shí)驗(yàn)中,非特異性染色會(huì)干擾靶標(biāo)信號(hào)的準(zhǔn)確判斷,其核心原因可歸為抗體相關(guān)問(wèn)題、樣本自身干擾、實(shí)驗(yàn)操作與試劑誤差三大類(lèi),需通過(guò)針對(duì)性對(duì)照實(shí)驗(yàn)逐步排查定位,具體分析如下:
一、非特異性染色的核心原因
1.抗體相關(guān)原因(最主要誘因)
抗體交叉反應(yīng):一抗可能與樣本中“非靶標(biāo)蛋白”存在同源序列或相似構(gòu)象(例如抗小鼠CD4抗體與大鼠樣本中的同源蛋白結(jié)合);二抗可能與樣本內(nèi)源性IgG結(jié)合(比如檢測(cè)人樣本時(shí),抗小鼠IgG二抗誤結(jié)合人自身IgG),導(dǎo)致假陽(yáng)性信號(hào)。
抗體特異性或純度不足:部分抗體(如未經(jīng)過(guò)流式驗(yàn)證的WB用抗體)本身特異性差,或制備過(guò)程中殘留雜蛋白,易非特異性吸附在細(xì)胞表面;多克隆抗體因識(shí)別多個(gè)表位,相比單克隆抗體更易出現(xiàn)非特異性結(jié)合。
抗體濃度過(guò)高:超過(guò)最佳濃度的抗體無(wú)法完全與靶標(biāo)結(jié)合,游離抗體或低親和結(jié)合的抗體難以通過(guò)洗滌去除,堆積在細(xì)胞表面導(dǎo)致背景升高。
熒光素偶聯(lián)問(wèn)題:熒光素與抗體偶聯(lián)效率低時(shí),殘留的游離熒光素會(huì)直接產(chǎn)生非特異性熒光;偶聯(lián)過(guò)程若破壞抗體構(gòu)象,也可能增加其非特異性結(jié)合能力。
2.樣本自身干擾
雜質(zhì)與死細(xì)胞殘留:細(xì)胞分離時(shí)未徹底去除紅細(xì)胞、血小板或組織消化后的膠原碎片,這些雜質(zhì)會(huì)非特異性吸附抗體;死細(xì)胞因細(xì)胞膜完整性破壞,胞內(nèi)疏水結(jié)構(gòu)暴露,不僅易結(jié)合抗體,還可能釋放DNA片段等物質(zhì)產(chǎn)生自發(fā)熒光。
內(nèi)源性熒光物質(zhì):部分細(xì)胞本身含熒光成分(如紅細(xì)胞的血紅蛋白、粒細(xì)胞的髓過(guò)氧化物酶),或樣本處理中引入熒光污染物(如血清中的熒光素、固定液殘留),直接疊加背景信號(hào)。
Fc受體介導(dǎo)的結(jié)合:巨噬細(xì)胞、單核細(xì)胞、B細(xì)胞等免疫細(xì)胞表面表達(dá)Fc受體,會(huì)主動(dòng)結(jié)合一抗的Fc段(尤其IgG類(lèi)抗體),無(wú)需抗原特異性即可形成非特異性信號(hào)。
3.實(shí)驗(yàn)操作與試劑誤差
洗滌不充分:抗體孵育后未用緩沖液反復(fù)離心洗滌,游離抗體或未結(jié)合試劑殘留,導(dǎo)致信號(hào)堆積。
緩沖液缺乏封閉劑或污染:PBS等緩沖液中未添加BSA、FBS等封閉劑,無(wú)法阻斷抗體與細(xì)胞表面非特異性位點(diǎn)的結(jié)合;緩沖液若被細(xì)菌、雜質(zhì)污染,也可能引入額外熒光或結(jié)合位點(diǎn)。
固定/破膜條件不當(dāng):多聚甲醛濃度過(guò)高或固定時(shí)間過(guò)長(zhǎng),會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞蛋白變性,產(chǎn)生更多非特異性結(jié)合位點(diǎn);破膜劑(如皂素)濃度失控,可能破壞細(xì)胞膜結(jié)構(gòu),使抗體非特異性進(jìn)入胞內(nèi)結(jié)合無(wú)關(guān)蛋白。
孵育條件異常:37℃孵育時(shí)間過(guò)久或室溫下孵育環(huán)境不穩(wěn)定,會(huì)加速抗體與非靶標(biāo)位點(diǎn)的非特異性結(jié)合。

二、通過(guò)對(duì)照實(shí)驗(yàn)排查原因的具體方法
對(duì)照實(shí)驗(yàn)需遵循“單一變量原則”,通過(guò)對(duì)比“實(shí)驗(yàn)組信號(hào)”與“對(duì)照組信號(hào)”,定位非特異性染色的來(lái)源,以下是必做對(duì)照及對(duì)應(yīng)排查目標(biāo):
1.空白對(duì)照:排查樣本/試劑自身熒光
設(shè)計(jì)方法:僅用緩沖液處理樣本,不加入任何一抗和二抗,其余操作(如離心、孵育、洗滌)與實(shí)驗(yàn)組完全一致。
排查邏輯:若空白對(duì)照信號(hào)顯著升高,說(shuō)明非特異性染色來(lái)自樣本自身自發(fā)熒光(如死細(xì)胞、內(nèi)源性熒光物質(zhì))或試劑污染(如緩沖液、離心管含熒光雜質(zhì)),而非抗體結(jié)合。
2.同型對(duì)照:排查抗體非特異性結(jié)合或Fc受體結(jié)合
設(shè)計(jì)方法:用與一抗“種屬、亞型、濃度完全一致”但無(wú)特異性結(jié)合能力的抗體(如無(wú)關(guān)IgG,如實(shí)驗(yàn)組用小鼠IgG1抗CD3,同型對(duì)照則用小鼠IgG1無(wú)關(guān)抗體)替代一抗,后續(xù)步驟與實(shí)驗(yàn)組相同。
排查邏輯:若同型對(duì)照信號(hào)高,說(shuō)明非特異性染色來(lái)自抗體本身的非特異性吸附(如抗體過(guò)量、純度差)或Fc受體介導(dǎo)的結(jié)合;若同型對(duì)照信號(hào)低,則可排除抗體自身問(wèn)題,聚焦其他原因。
3.二抗對(duì)照:排查二抗交叉反應(yīng)或游離熒光素
設(shè)計(jì)方法:不加入一抗,僅加入與實(shí)驗(yàn)組相同的二抗,其余操作不變。
排查邏輯:若二抗對(duì)照信號(hào)高,說(shuō)明問(wèn)題出在二抗——可能是二抗與樣本內(nèi)源性IgG交叉反應(yīng)(如人樣本用了抗小鼠IgG二抗,卻結(jié)合了人IgG),或二抗中殘留游離熒光素;若信號(hào)低,則可排除二抗問(wèn)題。
4.陰性細(xì)胞對(duì)照:排查一抗交叉反應(yīng)
設(shè)計(jì)方法:用已知“不表達(dá)靶標(biāo)蛋白”的細(xì)胞(如靶標(biāo)基因敲除細(xì)胞、無(wú)關(guān)細(xì)胞系,例如檢測(cè)HeLa細(xì)胞的CD44,陰性對(duì)照可用不表達(dá)CD44的CHO細(xì)胞)替代實(shí)驗(yàn)樣本,按常規(guī)步驟染色。
排查邏輯:若陰性細(xì)胞對(duì)照信號(hào)高,說(shuō)明一抗存在交叉反應(yīng)(即與非靶標(biāo)蛋白結(jié)合);若信號(hào)低,則證明一抗特異性良好,非特異性染色來(lái)自其他環(huán)節(jié)。
5.死細(xì)胞排除對(duì)照:排查死細(xì)胞干擾
設(shè)計(jì)方法:在樣本中加入死細(xì)胞染料(如PI、7-AAD,僅進(jìn)入死細(xì)胞并結(jié)合DNA發(fā)熒光),通過(guò)流式圈門(mén)分別分析“活細(xì)胞群”和“死細(xì)胞群”的信號(hào)強(qiáng)度。
排查邏輯:若排除死細(xì)胞后信號(hào)顯著降低,說(shuō)明非特異性染色主要來(lái)自死細(xì)胞的非特異性結(jié)合或自發(fā)熒光;若活細(xì)胞群信號(hào)仍高,則需聚焦活細(xì)胞相關(guān)的干擾因素。
6.Fc受體封閉對(duì)照:排查Fc受體結(jié)合
設(shè)計(jì)方法:將樣本分為兩組,一組先加入Fc受體封閉劑(如抗FcR抗體、10%同型血清)孵育10-15分鐘,再進(jìn)行常規(guī)染色;另一組不封閉,直接染色,對(duì)比兩組信號(hào)。
排查邏輯:若封閉組信號(hào)明顯低于未封閉組,說(shuō)明非特異性染色來(lái)自Fc受體介導(dǎo)的一抗結(jié)合;若兩組信號(hào)無(wú)差異,則可排除該因素。
三、結(jié)合對(duì)照結(jié)果的優(yōu)化方向
若空白對(duì)照高:更換無(wú)熒光污染的緩沖液/血清,用紅細(xì)胞裂解液去除紅細(xì)胞,或通過(guò)密度梯度離心(如Ficoll)去除死細(xì)胞碎片。
若同型對(duì)照高:先嘗試降低一抗?jié)舛龋ò凑f(shuō)明書(shū)1/2、1/4梯度測(cè)試),或加入Fc封閉步驟;若無(wú)效,更換流式驗(yàn)證過(guò)的高特異性抗體(如單克隆抗體替代多克隆抗體)。
若二抗對(duì)照高:更換與樣本種屬匹配的二抗(如人樣本用“抗小鼠IgG且無(wú)抗人交叉”的二抗),或?qū)Χ惯M(jìn)行12000g×5分鐘離心去除游離熒光素。
若陰性細(xì)胞對(duì)照高:更換針對(duì)靶標(biāo)獨(dú)特表位的一抗,或確認(rèn)一抗與樣本種屬的匹配性(如小鼠樣本避免用抗大鼠抗體)。
若死細(xì)胞排除后信號(hào)降低:實(shí)驗(yàn)中常規(guī)加入死細(xì)胞染料,分析時(shí)僅圈選活細(xì)胞;或優(yōu)化樣本制備流程,減少細(xì)胞死亡。
若Fc封閉后信號(hào)降低:將Fc封閉作為固定步驟,每次實(shí)驗(yàn)前用封閉劑處理樣本。






