Cell綜述:RNA修飾的新作用
日期:2014-09-03 09:11:21
迄今為止,科學(xué)家們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了上百種RNA修飾類型,但是其中大多數(shù)在mRNA和調(diào)控非編碼RNAs中還是很罕見的。近期的一些研究發(fā)現(xiàn)指出,這些修飾中有至少有一些含量豐富,且保守性強。本期Cell雜志以此為中心,介紹了兩種RNA修飾方式的分子機制,和生物學(xué)功能。
這兩種RNA修飾方式分別是N6-甲基腺苷化修飾(N6-methyladenosine, m6A),以及尿苷化修飾(uridylation,U-tail)。前者也就是第5個堿基——N6-甲基腺苷(m6A)。
這種修飾方式是在2012年,由來自康奈爾大學(xué)維爾醫(yī)學(xué)院的研究人員發(fā)現(xiàn)的,當(dāng)時研究人員發(fā)現(xiàn)長期被視作是生成蛋白質(zhì)的簡單藍圖的信使RNA(mRNA),它的一個堿基腺嘌呤上往往會被添加一個甲基(methyl group)而發(fā)生化學(xué)修飾。過去mRNA被認(rèn)為只包含4個堿基,這一研究表明第5個堿基——N6-甲基腺苷(m6A)遍布轉(zhuǎn)錄組。研究人員發(fā)現(xiàn)高達20%的人類mRNA常規(guī)發(fā)生了甲基化。超過5000種不同的mRNA分子包含m6A,這意味著這種修飾有可能廣泛的影響了基因的表達模式。
而且更重要的是,研究人員發(fā)現(xiàn)m6A存在于與人類疾病相關(guān)的基因編碼的大量mRNAs中,包括癌癥和幾種腦疾病例如自閉癥、阿爾茨海默氏癥和精神分裂癥,這表明這種修飾可以作為疾病治療的靶標(biāo)。
此后陸續(xù)的一些研究表明這種RNA修飾具有許多重要的功能,如今年1月,研究人員發(fā)現(xiàn)這種修飾的一個主要功能是控制RNA的壽命和降解,這一過程對于健康細(xì)胞發(fā)育極為重要。
RNA壽命延長將會導(dǎo)致生成更多的蛋白。如果這一去甲基化機制存在缺陷,就有可能大大地影響你的細(xì)胞蛋白質(zhì)水平。其中的一些蛋白質(zhì)有可能對于人類機體的能量調(diào)控至關(guān)重要,影響了肥胖。這一研究揭示了mRNA上的m6A修飾如何影響mRNA的半衰期轉(zhuǎn)而調(diào)控細(xì)胞蛋白質(zhì)數(shù)量的機制。
近來還有研究者發(fā)現(xiàn),通過減少m6A甲基化酶來抑制甲基化會擾亂生物鐘,使生物鐘周期延長。而過表達這種甲基化酶會使周期縮短。研究顯示,當(dāng)m6A甲基化被抑制時,細(xì)胞核的mRNA輸出受到延遲。此外細(xì)胞中還出現(xiàn)了廣泛的mRNA穩(wěn)定化,特別是與生物鐘有關(guān)的蛋白編碼mRNA。
而另外一種修飾方式:尿苷化(uridylation,U-tail)也具有一些特殊作用。2012年,研究人員發(fā)現(xiàn)了miRNAs生物形成途徑中的一名新成員:尿苷化轉(zhuǎn)移酶TUT7/4/2,并與之前研究成果結(jié)合,證明了尿苷化的雙重作用。
在這篇文章中,研究人員發(fā)現(xiàn)與標(biāo)準(zhǔn)的pre-miRNAs(group I,一類)不同,二類(group II)pre-miRNAs需要Drosha酶加工出一種更短的3’突出端——僅1 nt長,因此需要Dicer酶加工過程的3端單尿苷化(mono-uridylation)。而且值得注意到是,對于癌癥發(fā)生發(fā)展具有重要意義的let-7和miR-105兩種miRNAs,其大部分都屬于二類pre-miRNAs。
這些研究結(jié)果均表明了尿苷化的雙重作用,并指出 TUT7/4/2參與了miRNAs生物形成途徑,是這一途徑中的一名新成員。
為了能完成精確沉默各種不同mRNA的任務(wù),生物機體需要通過加工過程和成熟后處理等多種微調(diào)機制,確保其穩(wěn)定性和有效性。了解RNA的修飾過程,將有助于科學(xué)家們解析這一作用機制,以及這一機制出現(xiàn)問題后,如果進行彌補。
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